Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms