Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGP37231 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms