Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGM1P36871 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGM1P36871 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms