Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms