Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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