Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 526 ms