Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms