Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDSP20132 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDSP20132 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDSP20132 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDSP20132 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDSP20132 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDSP20132 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDSP20132 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDSP20132 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDSP20132 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDSP20132 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms