Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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PTPRAP18433 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PTPRAP18433 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PTPRAP18433 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRAP18433 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRAP18433 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRAP18433 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRAP18433 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRAP18433 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRAP18433 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRAP18433 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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