Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMD1P17707 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMD1P17707 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMD1P17707 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMD1P17707 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms