Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB1P16220 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms