Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms