Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms