Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHGAP10645 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHGAP10645 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms