Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI2P10070 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI2P10070 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms