Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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