Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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