Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms