Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms