Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms