Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms