Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms