Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms