Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms