Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXND1Q9Y4D7 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms