Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRIM35Q9UPQ4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM35Q9UPQ4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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