Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRP68Q9UHB9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRP68Q9UHB9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRP68Q9UHB9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRP68Q9UHB9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRP68Q9UHB9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRP68Q9UHB9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRP68Q9UHB9 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SRP68Q9UHB9 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRP68Q9UHB9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms