Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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