Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN3Q9P232 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms