Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TMEM30AQ9NV96 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TMEM30AQ9NV96 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TMEM30AQ9NV96 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TMEM30AQ9NV96 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TMEM30AQ9NV96 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TMEM30AQ9NV96 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TMEM30AQ9NV96 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TMEM30AQ9NV96 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TMEM30AQ9NV96 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TMEM30AQ9NV96 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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