Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms