Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms