Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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