Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms