Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms