Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms