Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms