Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX21Q969T3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms