Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms