Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms