Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms