Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM3CQ92520 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM3CQ92520 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM3CQ92520 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM3CQ92520 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM3CQ92520 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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