Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGDCC3Q8IVU1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms