Protein–RNA interactions for Protein: Q86V40

TRABD2A, Metalloprotease TIKI1, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2AQ86V40 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRABD2AQ86V40 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms