Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms