Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms