Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms