Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms