Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms