Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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